道教传入内蒙古地区是在金兴定三年(1219年)，是从成吉思汗遣派使臣刘仲禄，赴山东栖霞县诏请长春真人邱处机开始的。次年，长春真人邱处机率其弟子18人西行应诏，跋涉万里，于金兴定六年(1222年)始抵达西域大雪山(今兴都库什山，阿富汗境内)行营，拜见了成吉思汗。成吉思汗问道于长春真人，及安邦定国之策。长春真人言：“敬天爱民”“戒杀孝亲”“清净离欲”“和目养神”。成吉思汗大悦，因赐“邱神仙”之称，并特许广发“度牒”。凡持“度牒”者，可“免服兵役，不交赋税”。由此，邱处机获准在蒙古各地自由传道。其赐号“神仙”掌管天下道教。在大都(今北京)敕建白云观，促进了蒙汉文化的交流和发展。次年(1223年)，长春真人从西域返回大都途中，到达丰州古城(今呼和浩特市东郊)时，留其弟子李志常传播道教教义。李志常于元太祖十九年(1224年)，前往阿不罕山(今蒙古国境内)传道。并在当地兴建“栖霞观”，香火旺盛，并留驻于栖霞观。收蒙古贵族弟子19人入道，皆道业有成。并尊邱祖长春真人为“震旦活佛”。

道教在内蒙古地区传承，有记载的是在清康熙六十一年(1722年)由游方道人郭一峸传道。郭一喊为全真教龙门派第十一代弟子。全真教的传承是由师徒相传，按照邱祖长春真人所传的100个字相继排列传承。这百字代谱为：

道德通玄静，真常守太清。

一阳来复本，合教永圆明。

至理宗诚信，崇高嗣法兴。

世景永惟茂，希微衍自宁。

位修正仁义，超升云会登。

大妙中黄贵，圣体全用功。

虚空乾坤秀，金木性相逢。

山海龙虎交，莲开现宝新。

行满丹书诏，月盈祥光生。

万古续仙号，三界都是亲。

至民国传承到“永”字辈，如：玉皇阁的荣永修，鲁班庙的张永清，财神庙的孙永宁。“永”字辈下面是“圆”字辈道士，他们有：鲁圆月、郭圆聚、瞿圆阳、张圆广、李圆生、郑圆福、温圆志、许圆培等。“圆”字辈下面是“明”字辈，他们是：王明善、赵明久、范明证、周明生、王明峰(俗家弟子)、严明兴、云明祥、霍明祥、闫明柜、燕明庭等。“明”字下一辈道士是“至”字，他们有：解至善、刘至泰、王至和、焦至诚、李至仁、赵至忠、赵至全、霍至高、李至然、黑至修、王至信、刘至配、张至闲等。“至”字下一代道士是”理”字辈，他们有：纪理功、卢理生、杨理青、范理和等。“理”字下一代为“宗”字辈，他们有：王宗阳、胡宗魁(俗家)、宋宗阳、祝宗青(俗家)等。

历代相传，师徒相授。在内蒙古地区还有正一道士相传，多为散居。